Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms