Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TCF12Q99081 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCF12Q99081 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms