Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms