Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms