Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms