Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC7Q96M83 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms