Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms