Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf72Q96LT7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms