Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms