Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms