Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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RABGGTAQ92696 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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RABGGTAQ92696 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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