Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms