Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms