Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KBTBD3Q8NAB2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KBTBD3Q8NAB2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms