Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms