Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms