Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms