Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NME9Q86XW9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NME9Q86XW9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NME9Q86XW9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NME9Q86XW9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms