Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms