Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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USP43Q70EL4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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USP43Q70EL4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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