Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3HQ6NTF7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms