Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEF1DP3Q658K8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EEF1DP3Q658K8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EEF1DP3Q658K8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EEF1DP3Q658K8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EEF1DP3Q658K8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EEF1DP3Q658K8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EEF1DP3Q658K8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms