Protein–RNA interactions for Protein: Q5W186

CST9, Cystatin-9, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST9Q5W186 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CST9Q5W186 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms