Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms