Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM78Q5T7P6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM78Q5T7P6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM78Q5T7P6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM78Q5T7P6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM78Q5T7P6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM78Q5T7P6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM78Q5T7P6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM78Q5T7P6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM78Q5T7P6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM78Q5T7P6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM78Q5T7P6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM78Q5T7P6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM78Q5T7P6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM78Q5T7P6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM78Q5T7P6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM78Q5T7P6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM78Q5T7P6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM78Q5T7P6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM78Q5T7P6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM78Q5T7P6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM78Q5T7P6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM78Q5T7P6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM78Q5T7P6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM78Q5T7P6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM78Q5T7P6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM78Q5T7P6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TMEM78Q5T7P6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TMEM78Q5T7P6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TMEM78Q5T7P6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TMEM78Q5T7P6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TMEM78Q5T7P6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM78Q5T7P6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM78Q5T7P6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TMEM78Q5T7P6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM78Q5T7P6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TMEM78Q5T7P6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM78Q5T7P6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TMEM78Q5T7P6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM78Q5T7P6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TMEM78Q5T7P6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TMEM78Q5T7P6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TMEM78Q5T7P6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM78Q5T7P6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TMEM78Q5T7P6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM78Q5T7P6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMEM78Q5T7P6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMEM78Q5T7P6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMEM78Q5T7P6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMEM78Q5T7P6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMEM78Q5T7P6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMEM78Q5T7P6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMEM78Q5T7P6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMEM78Q5T7P6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMEM78Q5T7P6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMEM78Q5T7P6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMEM78Q5T7P6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMEM78Q5T7P6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMEM78Q5T7P6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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