Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY80

CATSPERE, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPEREQ5SY80 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CATSPEREQ5SY80 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms