Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms