Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms