Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms