Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRNQ4KMQ1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
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