Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIK1Q3SY52 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIK1Q3SY52 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms