Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
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