Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
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