Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF1Q15637 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF1Q15637 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF1Q15637 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF1Q15637 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF1Q15637 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF1Q15637 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF1Q15637 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF1Q15637 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF1Q15637 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SF1Q15637 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF1Q15637 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF1Q15637 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF1Q15637 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF1Q15637 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF1Q15637 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF1Q15637 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF1Q15637 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF1Q15637 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF1Q15637 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF1Q15637 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF1Q15637 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF1Q15637 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF1Q15637 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF1Q15637 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF1Q15637 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF1Q15637 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF1Q15637 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF1Q15637 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF1Q15637 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF1Q15637 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF1Q15637 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF1Q15637 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF1Q15637 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF1Q15637 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF1Q15637 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF1Q15637 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF1Q15637 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF1Q15637 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF1Q15637 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF1Q15637 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF1Q15637 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF1Q15637 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SF1Q15637 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SF1Q15637 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SF1Q15637 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SF1Q15637 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SF1Q15637 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SF1Q15637 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SF1Q15637 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SF1Q15637 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SF1Q15637 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SF1Q15637 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SF1Q15637 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SF1Q15637 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SF1Q15637 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SF1Q15637 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SF1Q15637 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SF1Q15637 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SF1Q15637 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SF1Q15637 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SF1Q15637 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SF1Q15637 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SF1Q15637 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SF1Q15637 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SF1Q15637 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SF1Q15637 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SF1Q15637 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SF1Q15637 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SF1Q15637 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SF1Q15637 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SF1Q15637 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SF1Q15637 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SF1Q15637 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SF1Q15637 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SF1Q15637 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SF1Q15637 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SF1Q15637 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SF1Q15637 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SF1Q15637 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SF1Q15637 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SF1Q15637 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SF1Q15637 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SF1Q15637 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SF1Q15637 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SF1Q15637 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SF1Q15637 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SF1Q15637 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SF1Q15637 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SF1Q15637 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SF1Q15637 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SF1Q15637 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SF1Q15637 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SF1Q15637 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SF1Q15637 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SF1Q15637 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SF1Q15637 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SF1Q15637 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SF1Q15637 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SF1Q15637 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms