Protein–RNA interactions for Protein: Q15334

LLGL1, Lethal(2) giant larvae protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL1Q15334 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LLGL1Q15334 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms