Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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