Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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