Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms