Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNB1Q14721 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms