Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPSQ13938 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPSQ13938 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPSQ13938 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPSQ13938 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPSQ13938 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPSQ13938 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CAPSQ13938 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPSQ13938 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPSQ13938 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CAPSQ13938 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPSQ13938 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPSQ13938 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPSQ13938 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPSQ13938 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPSQ13938 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPSQ13938 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPSQ13938 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPSQ13938 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPSQ13938 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPSQ13938 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPSQ13938 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPSQ13938 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAPSQ13938 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPSQ13938 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAPSQ13938 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPSQ13938 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPSQ13938 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPSQ13938 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPSQ13938 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPSQ13938 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPSQ13938 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPSQ13938 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPSQ13938 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPSQ13938 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPSQ13938 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPSQ13938 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPSQ13938 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPSQ13938 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPSQ13938 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAPSQ13938 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAPSQ13938 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPSQ13938 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPSQ13938 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPSQ13938 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPSQ13938 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPSQ13938 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPSQ13938 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPSQ13938 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPSQ13938 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPSQ13938 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPSQ13938 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPSQ13938 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CAPSQ13938 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CAPSQ13938 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPSQ13938 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPSQ13938 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPSQ13938 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPSQ13938 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPSQ13938 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CAPSQ13938 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPSQ13938 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPSQ13938 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPSQ13938 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPSQ13938 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPSQ13938 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPSQ13938 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPSQ13938 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPSQ13938 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPSQ13938 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPSQ13938 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPSQ13938 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPSQ13938 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPSQ13938 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPSQ13938 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPSQ13938 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPSQ13938 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPSQ13938 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPSQ13938 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPSQ13938 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPSQ13938 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPSQ13938 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPSQ13938 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPSQ13938 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPSQ13938 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPSQ13938 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPSQ13938 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPSQ13938 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPSQ13938 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPSQ13938 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPSQ13938 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPSQ13938 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPSQ13938 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPSQ13938 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPSQ13938 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPSQ13938 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPSQ13938 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPSQ13938 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPSQ13938 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPSQ13938 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms