Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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PEX6Q13608 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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PEX6Q13608 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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PEX6Q13608 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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PEX6Q13608 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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