Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms