Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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