Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RESTQ13127 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RESTQ13127 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RESTQ13127 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RESTQ13127 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RESTQ13127 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RESTQ13127 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RESTQ13127 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RESTQ13127 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RESTQ13127 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RESTQ13127 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RESTQ13127 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RESTQ13127 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RESTQ13127 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RESTQ13127 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RESTQ13127 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RESTQ13127 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RESTQ13127 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RESTQ13127 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RESTQ13127 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RESTQ13127 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RESTQ13127 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RESTQ13127 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RESTQ13127 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RESTQ13127 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RESTQ13127 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RESTQ13127 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RESTQ13127 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RESTQ13127 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RESTQ13127 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RESTQ13127 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RESTQ13127 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RESTQ13127 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RESTQ13127 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RESTQ13127 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RESTQ13127 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RESTQ13127 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RESTQ13127 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RESTQ13127 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RESTQ13127 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RESTQ13127 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RESTQ13127 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RESTQ13127 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RESTQ13127 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RESTQ13127 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RESTQ13127 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RESTQ13127 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RESTQ13127 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RESTQ13127 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RESTQ13127 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RESTQ13127 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RESTQ13127 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RESTQ13127 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RESTQ13127 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RESTQ13127 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RESTQ13127 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RESTQ13127 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RESTQ13127 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RESTQ13127 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RESTQ13127 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RESTQ13127 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RESTQ13127 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RESTQ13127 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RESTQ13127 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RESTQ13127 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RESTQ13127 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RESTQ13127 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RESTQ13127 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RESTQ13127 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
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RESTQ13127 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RESTQ13127 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RESTQ13127 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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RESTQ13127 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RESTQ13127 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
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RESTQ13127 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RESTQ13127 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RESTQ13127 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RESTQ13127 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RESTQ13127 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RESTQ13127 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RESTQ13127 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RESTQ13127 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RESTQ13127 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RESTQ13127 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RESTQ13127 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RESTQ13127 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RESTQ13127 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RESTQ13127 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RESTQ13127 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RESTQ13127 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RESTQ13127 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RESTQ13127 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RESTQ13127 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RESTQ13127 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms