Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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