Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
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