Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms