Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms