Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EP300Q09472 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EP300Q09472 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EP300Q09472 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EP300Q09472 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EP300Q09472 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EP300Q09472 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EP300Q09472 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EP300Q09472 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EP300Q09472 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EP300Q09472 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EP300Q09472 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EP300Q09472 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EP300Q09472 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EP300Q09472 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EP300Q09472 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EP300Q09472 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EP300Q09472 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EP300Q09472 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EP300Q09472 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EP300Q09472 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EP300Q09472 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EP300Q09472 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EP300Q09472 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EP300Q09472 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EP300Q09472 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EP300Q09472 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EP300Q09472 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EP300Q09472 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EP300Q09472 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EP300Q09472 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EP300Q09472 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EP300Q09472 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EP300Q09472 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EP300Q09472 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EP300Q09472 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EP300Q09472 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EP300Q09472 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EP300Q09472 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EP300Q09472 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EP300Q09472 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EP300Q09472 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EP300Q09472 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EP300Q09472 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
EP300Q09472 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EP300Q09472 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EP300Q09472 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EP300Q09472 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EP300Q09472 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EP300Q09472 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EP300Q09472 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EP300Q09472 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EP300Q09472 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EP300Q09472 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EP300Q09472 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EP300Q09472 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EP300Q09472 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EP300Q09472 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
EP300Q09472 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EP300Q09472 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EP300Q09472 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EP300Q09472 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EP300Q09472 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EP300Q09472 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
EP300Q09472 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EP300Q09472 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EP300Q09472 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EP300Q09472 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EP300Q09472 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EP300Q09472 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EP300Q09472 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms