Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms